目前对病毒性脑炎的分类方法并不统一，包括按病因学、症状学、定位体征或病理形态学来进行分类。从现代病毒学和免疫学的观点出发，以病因学结合发病特点来分类也比较合理。现将病毒性脑炎分为三大类：
　　
   确定是病毒所致的脑炎有二大类：
　　
   1.以节足动物为媒介的病毒性脑炎
　　
   （1）蚊媒病毒性脑炎 
   ①甲组蚊（或虫）媒病毒脑炎：西方马脑炎，东方马脑炎，委内瑞拉马脑炎，辛德贝斯病毒（Sindbis virus）脑炎，西门里克森林病毒（Semliki forest virus）脑炎，基肯尼亚病毒（Chikungunya virus）脑炎。
   ②乙组蚊媒病毒（或称黄病毒flavivirus）脑炎；圣路易脑炎，流行性乙型脑炎，墨莱溪谷脑炎（Murray valley encephalitis），以及雪鞋兔病毒（snnowshoe hare virus）脑炎。
　　
   （2）经蜱传播的森林脑炎。
　　
   2.不经节足动物传播的病毒性脑炎 包括肠道病毒所致的脊髓灰质炎，埃可病毒和柯萨奇病毒脑炎，疱疹病毒脑炎（单纯疱疹及带状疱疹病毒），腮腺炎病毒脑炎，流行性病毒脑炎，淋巴脉络膜丛脑膜炎及狂犬病毒脑炎等，均在有关章节中叙述。此外还有Epstein-Barr病毒所致的脑炎，巨细胞包涵体病毒脑炎及腺病毒脑炎等。近年来慢性病毒性脑炎已为人们所公认。应用电子显微镜和免疫血清学的研究，已证明麻疹病毒可致亚急性硬化性全脑炎（subacute sclerosingpanencephalitis，SSPE），乳头多瘤空泡病毒（papovavirus）可引起慢性进行性多灶性脑白 质 炎（progressive multifocal leukoencephalopathy，简称PML）。此类慢性感染以很长的潜伏期，进行性病程为其特点，往往有先天性免疫缺陷。此外，脑心肌炎病毒感染人后，可发生麻痹及脑脊液细胞增加，感染黑猩猩则还可发生心肌炎。40％～50％的成人AIDS患者及多数此病患儿临床表现有明显的神经系统，且尸检发现70％～80％的成人患者有神经病理学改变，认为可能是HIV所致。已从患者的中枢神经系统分离到HIV，且通过细胞免疫化学和原位杂交已检测到HIV的抗原和核酸。
　　
   3.其他脑炎
　　
   （1）可能是病毒引起的脑炎：包括昏睡性脑炎（又称甲型脑炎或von economo脑炎），多发性硬化症等。
　　
   （2）感染后脑炎：某些病毒感染所致的急性传染病，可以在病程中续发以弥漫性脑和脊髓脱髓鞘为特点的脑炎，也称为变应性脑炎、继发性脑炎或急性脱髓鞘性脑炎，例如在麻疹、风疹、水痘感染后所发生的脑炎。但有人认为这些病毒也有直接侵犯中枢神经系统引起脑炎。
　　
   （3）接种后脑炎：接种狂犬病疫苗后可引起脑炎，在有关章节中叙述。